Марлон Мари - одна из худших студенток в истории Зальбургской академии алхимии. Ингрид, наставница Мари, дает ей мастер-класс и ограничивает по времени: если Мари в течении пяти лет сможет создать предмет под названием Popular Synthetic который впечатлит Ингрид, то Марлон закончит школу. В оригинальной версии игры есть 6 возможных концовок, в обновлённой версии для PlayStation, изданной ранее для Saturn и известной как версия 1.3 или Marie no Atelier Plus: Salberg no Renkinjutsushi, а так же в последующих выпусках была добавлена 7-я концовка, множество уникальных событий, мини-игр и поддержка DualShock.